Além de ter liderado a comitiva portuguesa aos Jogos de Atlanta, foi vice-presidente da Comissão Executiva do COP, entre 1993 e 1997, durante a presidência de Vasco Lynce.
Já com José Vicente de Moura como presidente do COP, Victor Fonseca da Mota assumiu o cargo de secretário-geral durante o ciclo olímpico de 1997 a 2000.
Membro de mérito do COP, Victor Fonseca da Mota integrou ainda o Conselho Superior do Desporto entre 1993 e 2004.
