O incêndio fez ainda 50 feridos, escreveu no sábado o Corpo de Bombeiros de Jacarta na rede social Twitter.
A estação de armazenamento de combustível, operada pela empresa estatal de petróleo e gás Pertamina, fica perto de uma área densamente povoada no bairro de Tanah Merah, a norte da capital indonésia.
Imagens do incêndio, difundidas pelas cadeias televisivas, mostraram centenas de pessoas a correr em pânico enquanto espessas nuvens de fumo preto enchiam o céu. Pelo menos 260 bombeiros foram destacados para o local.
O chefe da polícia nacional, Listyo Sigit Prabowo, disse que uma investigação preliminar revela que o incêndio foi causado por um problema técnico que envolveu o excesso de pressão na receção de combustível da refinaria Balongan, na província de Java Ocidental.
"Descobriu-se que ocorreu um incêndio durante o abastecimento de combustível Pertamax", disse Listyo em conferência de imprensa no sábado, referindo-se a um tipo de óleo combustível produzido pela Pertamina.
Equipas de resgate continuam hoje à procura de três pessoas desaparecidas. Cerca de 35 feridos ainda se encontram a receber tratamento em cinco hospitais e mais de 1.300 pessoas foram retiradas do local e levadas para dez abrigos do Governo, um posto da Cruz Vermelha e um estádio desportivo, ainda de acordo com Listyo Sigit Prabowo.
A diretora executiva da Pertamina, Nicke Widyawati, já lamentou o sucedido e comprometeu-se a fazer "um estudo interno exaustivo para assegurar que um acidente semelhante não volte a acontecer".
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